Фамилия Шушарева — женская форма фамилии Шушарев, и её происхождение стоит искать в прозвище, которое дали предку. Основа фамилии — слово «шушара» или «шушарый». В русских говорах, особенно в северных и сибирских, «шушара» — это мелкий, нечистый на руку человек, плут или пройдоха, а также неряха, растрёпа. В словаре Владимира Даля есть глагол «шушарить» — шуршать, возиться, а также делать что-то украдкой. Так что прозвище Шушара могло закрепиться за человеком с неспокойным, суетливым характером или за тем, кто промышлял мелкими кражами.

Словообразовательная модель здесь классическая для русских фамилий: суффикс -ев (встречается реже, чем -ов, но по той же схеме) присоединился к основе «Шушар». Форма Шушарев буквально означает «сын Шушары». В женском роде фамилия склоняется по стандартному типу: Шушарева, Шушаревой, Шушареву.

Интересно, что фамилия Шушарев (и Шушарева) довольно редкая. Она не входит в списки массовых русских фамилий, и её географическое распространение, по данным современных исследований, сосредоточено в основном в центральных областях России — в частности, в Тверской и Московской областях. Это может указывать на локальное происхождение прозвища, которое не вышло за пределы определённой местности. В отличие от фамилий от крестильных имён (Иванов, Петров), эта фамилия — прямая отсылка к личной характеристике предка, и в ней нет религиозного подтекста.

Стоит отметить, что в редких случаях основой могло стать не прозвище, а диалектное название птицы — шушара (так в некоторых говорах называют сойку, птицу с пёстрым оперением). Если это так, то фамилия могла возникнуть из-за сходства человека с этой крикливой и заметной птицей. Однако версия с прозвищем «плут» или «неряха» кажется более правдоподобной, поскольку прозвища по поведению давались чаще, чем по сходству с животным.

Никаких сведений о дворянском происхождении фамилии Шушарева нет. Вероятнее всего, это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде простого народа. Носительница фамилии может проследить свою родословную до человека, которого в деревне называли Шушарой — и это прозвище, пусть и нелестное, со временем стало фамильным знаком.