Фамилия Шушенькова образована от прозвища Шушенько, которое восходит к глаголу «шушукать» – «говорить шепотом, шептаться». Вероятно, так называли того, кто шептался. Не исключено, что прозвище Шушенька употреблялось в переносном смысле и закреплялось за скрытным, подозрительным человеком, делающим все в тайне. В таком случае прозвище Шушенька получил человек, не любивший шум. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шушенька, со временем получил фамилию Шушенькова.