Фамилия Шутков образована от прозвища Шутка, которое восходит к аналогичному нарицательному со значением «то, что говорят или делают ради развлечения, ради возбуждения смеха, веселья, забавы, шалости». Позже прозвище Шутка приобрело слегка отрицательный оттенок – «ломака, кривляка».