Фамилия Шуяновы образована по стандартной русской модели от названия города Шуя (Ивановская область). Основа — топоним Шуя, суффикс -ов, указывающий на принадлежность: Шуянов буквально означает «человек из Шуи». Такие фамилии часто давали переселенцам, которые переезжали в другие места и получали прозвище по прежнему месту жительства. В русской ономастике это типичный случай так называемых «географических» фамилий — их носители редко были знатными, чаще это крестьяне или посадские люди, записанные в другом уезде как «Шуянин» или «Шуянов».

Происхождение самого названия города Шуя спорно. По наиболее распространённой версии, слово финно-угорского происхождения и означает «болотистая, топкая местность» (ср. карельское suja — «топь»). Другая гипотеза связывает его с древнерусским «ошую» — «с левой стороны» (левобережье реки Тезы), но лингвисты считают эту версию менее убедительной, так как топонимы редко образуются от наречий. В любом случае, корень фамилии не связан с «шитьём» или «шуей» как частью тела — это чистый топоним.

Фамилия Шуяновы не относится к числу очень распространённых, но встречается в центральной России, особенно в бывшей Владимирской губернии и соседних регионах. Встречается и вариант Шуянин — он даже более прозрачен по смыслу, но менее типичен для фамилии из-за суффикса -ин. Социальный контекст ясен: предки Шуяновых — скорее всего, выходцы из города Шуи или окрестных деревень, которые в XVII–XIX веках переселились в другие края и закрепили за собой прозвище по родине. Дворянских родов с такой фамилией в истории не зафиксировано, что подтверждает её «народное» происхождение.

Ударение в фамилии обычно падает на второй слог — Шуя́новы, хотя в бытовой речи встречаются варианты. Важно помнить, что, несмотря на внешнее сходство со словом «шуя» (левая рука в церковнославянском), фамилия почти наверняка топонимическая: город Шуя известен с XIV века, а прозвища по частям тела в русских фамилиях редки и обычно имеют другой суффикс (например, Шуйкин).