Фамилия Шуйдин — редкий случай, когда географическое название почти наверняка перешло в прозвище, а затем в фамилию, но с неочевидным суффиксом. Вопреки ожиданиям, она не образована стандартной моделью «река + -ин» (как, скажем, Волгин). Основа здесь — Шуя, а суффикс -дин указывает на усечённую форму притяжательного прилагательного: Шуйдин буквально значит «сын Шуи» или, что точнее, «человек, имеющий отношение к Шуе».

Шуя — это и город в Ивановской области (известный с XIV века), и несколько рек с таким названием (от финно-угорского *šuja — «суженая, протока»). Предок носителя фамилии мог получить прозвище Шуя по месту жительства: если он переехал из города Шуя в другую местность, его могли называть «Шуя» или «Шуйский». Однако суффикс -дин, а не -ский, выдаёт недворянское, крестьянское или посадское происхождение. В русской ономастике суффикс -ин (в данном случае -дин) типичен для фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а, -я: Шуя → Шуйдин (ср. Кузьма → Кузьмин, но здесь основа на -я даёт переходное -й-).

Есть и более прозаичная версия: фамилия могла возникнуть от мирского имени Шуя, которое давали ребёнку в семье, связанной с городом или рекой. В писцовых книгах XVI–XVII веков встречаются крестьяне с прозвищем Шуя, но фамилия Шуйдин — довольно редкая. По данным переписей XIX века, она фиксируется в основном в центральных губерниях России (Костромская, Владимирская, Нижегородская), что косвенно подтверждает связь с верхневолжским регионом, где находится Шуя.

Любопытно, что фамилия Шуйдин не имеет отношения к знаменитому роду князей Шуйских: те носили суффикс -ский, указывающий на владение землёй, тогда как Шуйдины — потомки простых людей, уехавших из Шуи или живших на реке Шуе. Если ваш предок носил эту фамилию, он, скорее всего, был крестьянином или ремесленником, а его прозвище — просто указанием на родину.