Фамилия Сиденов — редкий случай, когда прозвище, скорее всего, образовано не от действия, а от состояния. В основе лежит диалектный глагол «сидеть» в значении «быть оседлым, жить на одном месте», но не в смысле малоподвижности, а в смысле «оседлости, постоянного проживания». В северных и сибирских говорах «сидень» или «сиден» — это человек, который прочно обосновался на земле, не кочует, в отличие от «пришлых» или «захожих». Так могли прозвать старожила, коренного жителя, который «сидит» на своём участке из поколения в поколение.

Суффикс -ов указывает на стандартную модель русской фамилии — по отцу. То есть Сиденов — это «сын Сидена». Само же прозвище Сиден могло возникнуть и в другой среде: в артелях или на промыслах «сиднем» называли того, кто постоянно находился при деле, не отлучался, например, сторожа или караульщика. В этом случае фамилия фиксирует не столько социальный статус, сколько профессиональную черту — надёжность и привязанность к месту работы.

С точки зрения географии, фамилия Сиденов встречается спорадически, без ярко выраженного гнезда, что типично для прозвищ, а не для имён из святцев. Она не связана с крестильным именем Сидор (в отличие от Сидоров), и это важное различие: Сиденов — чисто прозвищная фамилия, а не патроним от церковного имени. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) модель на -енов от основ на -ен встречается реже, чем на -ин или -ов, что делает фамилию дополнительно интересной для этимолога.

Вторая, менее вероятная версия — отчество от имени Сиденя, уменьшительной формы от Сидор или Силантий. Но для такого объяснения нет прочных диалектных подтверждений, и первая версия (от прозвища «сидень») выглядит убедительнее: она проще, логичнее и объясняет редкую словообразовательную форму.