Фамилия Сидоркова образована от имени Сидорка — народной, обиходной формы крестильного имени Сидор. В церковном календаре ему соответствует греческое Исидор, что в переводе означает «слуга богини Исиды». Имя попало на русскую почву вместе с христианством, но в быту греческое «Исидор» быстро сократили до простого и звучного «Сидор».

Покровителем имени считают святого Исидора Юрьевского, погибшего вместе с товарищами 8 января 1482 года от рук ливонских рыцарей в Юрьеве. Эта мученическая кончина закрепила за именем уважение, однако на форму фамилии повлияла не церковная традиция, а живая речь. Именно от уменьшительного Сидорка, а не от полного Сидор, и пошла фамилия Сидоркова.

Суффикс -к- в основе указывает на то, что имя носило ласкательный или просто обиходный оттенок. Так в семье могли звать ребенка, а затем это прозвание закрепилось за его потомками. Патронимическая модель с суффиксом -ов- типична для русских фамилий, образованных от имен на согласный: сын Сидорки становился Сидорковым.

Скорее всего, основатель рода Сидорковых был выходцем из рабочей или крестьянской среды. В среде духовенства и дворянства чаще использовали полные формы имени, тогда как простонародная среда охотно сокращала и переделывала календарные имена на свой лад. Фамилия Сидоркова, таким образом, хранит память не только об имени предка, но и о той социальной среде, где это имя бытовало в своей самой живой, разговорной форме.