Фамилия Силигова — женская форма, а её мужской вариант — Силигов. В центре разбора оказывается не очевидный корень, а суффикс и редкая модель образования. Если бы фамилия оканчивалась на -ов или -ин, она бы легко выводилась из имени или прозвища, но -ов здесь нестандартный: основа «Силиг» выглядит как усечённая или иноязычная.

Вероятнее всего, в основе лежит тюркское или кавказское мужское имя Силик, Силиг, восходящее к слову со значением «чистый», «ясный» или «благородный». Суффикс -ов (-ова) в таком случае — обычный русский патронимический показатель, который добавили при оформлении фамилии по русскому образцу. Носители фамилии могли происходить из регионов, где русские фамилии формировались у тюркоязычных или горских народов: Поволжье, Северный Кавказ, Закавказье. В пользу этого говорит и редкость фамилии: она почти не встречается в центральных русских областях, зато фиксируется в документах по Осетии и Дагестану.

Менее вероятная версия связывает основу с диалектным русским словом «силига» — так в некоторых говорах называли слабого, хилого человека. Но тогда логичнее было бы ожидать суффикс -ин (Силигин), а не -ов. Кроме того, слово «силига» очень локально и не дало массовых фамилий. Поэтому тюркское или кавказское происхождение выглядит правдоподобнее.

Фамилия Силигова — пример того, как русская патронимическая модель «наложилась» на иноязычное имя, и получилась форма, которая на слух звучит по-русски, но по корню выдаёт иные этнические корни. Встретить её можно преимущественно на юге России и в Закавказье.