Фамилия Сисанбаева — яркий пример тюркского наследия в русском ономастиконе. Её основа, мужское имя Сисанбай, составная: первая часть «Сисан» восходит к арабскому «сисан» (красивый, благородный) или к тюркскому «сысан» (острый, колющий, как у оружия), а вторая — «бай» (господин, богач, хозяин). Таким образом, имя Сисанбай означало «красивый и богатый» или «острый, как копьё, господин» — прозвище, указывавшее на уважаемого, заметного человека.

Суффикс «-ев» в фамилии (вместо более ожидаемого тюркского «-ов») — результат адаптации к русской грамматике: женская форма Сисанбаева образована от мужской Сисанбаев, где «-ев» присоединён к основе на мягкий согласный (бай). Такая модель типична для фамилий, возникших в Поволжье, Приуралье и Казахстане, где тюркские имена смешивались с русскими патронимическими суффиксами. В отличие от русских фамилий на «-ин», где основа часто оканчивается на «-а» или «-я», здесь мы видим чистый суффикс принадлежности.

Географически фамилия Сисанбаева встречается в основном среди башкир, татар и казахов, особенно в Оренбургской и Челябинской областях, а также в Башкортостане. В этих регионах имя Сисанбай было распространено ещё в XIX веке, о чём свидетельствуют записи в метрических книгах и ревизских сказках. Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к башкирским или татарским тептярям или государственным крестьянам — людям, которые вели оседлый образ жизни, занимались земледелием и скотоводством.

Интересно, что двойной корень «Сисан-бай» не имеет прямых аналогов в русских фамилиях, но родственен другим тюркским именам с компонентом «бай»: Бикбай, Ишбай, Тукбай. В отличие от них, первая часть «Сисан» редка и указывает на то, что предок носителя фамилии, вероятно, выделялся не только богатством, но и личными качествами — красотой или воинской доблестью. Споров о происхождении практически нет: тюркская основа очевидна, а вариант с арабским заимствованием лишь уточняет оттенок значения.