Фамилия Сисан — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Она не вписывается в типичные модели русских фамилий на -ов, -ев или -ин, что сразу указывает на её возможное позднее происхождение или нерусские корни.

Самый прямой путь к разгадке — поиск географического «следа». Фамилия Сисан встречается у народов Северного Кавказа, в частности у осетин и ингушей. В осетинском языке «сисан» (с ударением на второй слог) означает «сороконожка» или «многоножка». Прозвище могли дать человеку за суетливость, быстроту движений или, наоборот, за внешнюю особенность. В ингушском языке «сиса» — это «сито», а «сисан» — форма, указывающая на принадлежность или отношение к этому предмету. Предок мог быть мастером по изготовлению сит либо получить прозвище за свой «просеивающий», дотошный характер.

Вторая, менее вероятная, но возможная версия — искусственное происхождение. Фамилия могла возникнуть в семинарской среде. В духовных училищах ученикам нередко давали фамилии от латинских или греческих слов. Латинское sistans (стоящий, останавливающийся) в русской передаче могло сократиться до Сисан. Однако эта версия слаба, так как в реальных списках семинаристов такая фамилия не зафиксирована.

Третий вариант — западноевропейское заимствование. В польском и украинском языках есть слово «сисана» (просторечное название груши-дички). Переселенцы с запада могли принести это прозвище на восток, но и тут след теряется — фамилия почти не встречается в традиционных польских гербовниках.

Фамилия Сисан не имеет отношения к русскому глаголу «сиснуть» (устаревшее «шептать») или к слову «сиська» — это ложные ассоциации, которые возникают у носителей языка без специальной подготовки.

Что касается суффикса, то фамилия образована без типичного русского патронимического окончания. Это так называемая «чистая» основа, что характерно для фамилий тюркского, кавказского или украинского происхождения. Если бы фамилия была русской, она звучала бы как Сисанов или Сисин.

Таким образом, наиболее правдоподобно, что фамилия Сисан — это русифицированная запись кавказского прозвища или родового имени, закреплённая в документах в XIX–XX веках. Носители фамилии, скорее всего, происходят из горных регионов Кавказа, а их предки занимались ремеслом или получили прозвище по характерной черте поведения.