Фамилия Сисеналин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет типичных русских суффиксов -ов, -ев или -ин, образованных от имени отца, что сразу наводит на мысль: перед нами нестандартная модель. Скорее всего, перед нами фамилия тюркского или кавказского корня, адаптированная русским окончанием -ин.

Разберём основу. «Сисена» или «Сисен» — это не русское слово. Можно предположить, что в основе лежит тюркское имя или прозвище. В казахском, татарском или башкирском языках есть корень «сис» (сись) — «набухать», «вздуваться», «опухать» или же «сися» — «сосок», «грудь». Однако прямое прозвище по физическому признаку (например, «толстый» или «пухлый») звучит грубовато, но для прозвищ в прошлом это было обычным делом. Есть и другая версия: «Сисена» может быть фонетическим искажением арабского имени «Сисен» (вариант «Хусейн» или «Хасан») при переходе через тюркские диалекты. В таком случае фамилия означает «потомок Сисена» (человека, носившего такое имя).

Суффикс -ин в фамилии Сисеналин — характерный русский патронимический показатель, который в этом случае присоединился не к имени, а к уже готовому прозвищу или имени Сисена, причём с дополнительным суффиксом -л-. Это редкая модель: обычно -ин добавляют к основам на -а/-я (Петя — Петин), а здесь мы видим «Сисена» + «л» + «ин». Такое могло возникнуть, если прозвище звучало как «Сисенала» (например, в казахском «Сисенала» — «сытый», «толстяк»). Тогда фамилия Сисеналин — это «чей?» — «сын Сисеналы».

Географически фамилия должна быть привязана к регионам, где смешивались русское и тюркское население: Поволжье, Урал, Западная Сибирь, Северный Кавказ. Поскольку фамилия очень редкая, точных данных о сословной принадлежности предков нет — это могли быть крестьяне, казаки или мещане, принявшие фамилию при переписях XIX века. В любом случае, Сисеналин — яркий пример фамилии, которая хранит в себе искажённое тюркское слово или имя, обрусевшее через суффикс.