Фамилия Сисеновых — одна из тех, что ставит в тупик при первом взгляде. Корень «сисен-» не встречается в общеупотребительной лексике, и это сразу подсказывает: перед нами не профессиональное или прозвищное имя, а скорее всего искажённое личное имя или заимствование.

Самый вероятный путь образования — от тюркского или кавказского мужского имени Сисен. Вариантов несколько: в некоторых тюркских языках «сисен» означает «сорок», что могло быть элементом сложного имени (сорок воинов, сорок лет и т. д.), либо это адаптация арабского имени Хасан через диалектное произношение. В русской среде такие имена нередко превращались в фамилии с помощью суффикса -ов, который указывает на принадлежность: «Сисенов» — сын Сисена. Форма Сисеновых — это родительный падеж множественного числа, традиционная для записи в документах XVIII–XIX веков (чьи? — Сисеновых), и позже закрепившаяся как фамилия.

Географически фамилия тяготеет к южным регионам России — Поволжье, Северный Кавказ, Астраханская область. Там, где веками соседствовали русские, татары, ногайцы и калмыки, подобные тюркские основы в русских фамилиях — обычное дело. Носители Сисеновых могли быть крещёными татарами или выходцами из казачьих станиц, воспринявшими фамилию от отца или деда с нерусским именем.

Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с диалектным словом «сисёнка» (синица в некоторых говорах) или «сисый» (сытый, упитанный). Однако эти версии слабее, потому что суффикс -ен- в основе нехарактерен для русских прозвищ от птиц или прилагательных. Тюркское происхождение остаётся основным и наиболее логичным.

Фамилия редкая, нечастотная даже в южных областях. Это не род Рюриковичей и не купеческая династия — скорее всего, предки были крестьянами или однодворцами, получившими фамилию по отцу при переписях. В современных справочниках Сисеновых почти нет, что делает её интересным объектом для семейного историка.