Фамилия Сисеева — женская форма от Сисеев, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель «-ев» указывает на притяжательное значение: «чей?» — Сисеев, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Сисой. Суффикс «-ев», а не «-ов», появляется после мягких и шипящих согласных, что как раз и происходит в основе Сисой (основа на -й, которая смягчается). Таким образом, фамилия образована по самой распространённой русской патронимической модели.

Основа фамилии — каноническое мужское имя Сисой. Это церковное имя греческого происхождения, восходящее к древнееврейскому «Сисай» или «Сисой», которое в православных святцах связано с несколькими преподобными, в том числе с египетским пустынником IV века. В разговорной речи имя нередко меняло форму: в документах XVII–XVIII веков встречаются варианты Сисой, Сисей, Сысой (с «ы» под влиянием аканья и народной этимологии). От последнего пошли фамилии Сысоев, Сысоева, которые гораздо чаще попадаются в современных справочниках. Сисеев же — более редкий, книжный вариант, сохранивший исходное «и» в корне.

В быту имя Сисой было распространено среди крестьян и посадских людей центральной России, особенно в Поволжье и на Русском Севере. Это подтверждается переписными книгами: например, в писцовых книгах Новгородской земли начала XVII века упоминаются крестьяне с именем Сисойко. Соответственно, предок современных Сисеевых мог быть обычным земледельцем или ремесленником, которого в документах записали по отцу — Сисоевым.

Интересная деталь: в отличие от массовых фамилий на «-ов», Сисеев встречается локально. По данным региональных телефонных справочников и архивов ЗАГС, основная зона бытования фамилии — Рязанская, Тамбовская и Нижегородская области. Это говорит о том, что фамилия не разошлась широко по стране, а закрепилась в нескольких крестьянских родах. Встречается она и у староверов, которые часто сохраняли архаичные формы имён.

С точки зрения ударения, фамилия произносится с ударением на втором слоге: Сисéев. Первый слог безударный, что иногда приводит к путанице на письме — люди ошибочно пишут «Сысеев», путая с более ходовым вариантом. Но в паспорте и документах, если фамилия записана через «и», это именно та, исходная форма.

Таким образом, Сисеева — это не просто вариация Сысоева, а самостоятельная фамилия с книжным, несколько архаичным корнем, которая сохранила первоначальное звучание церковного имени. Носительницы этой фамилии могут считать, что их предки были людьми, которых в церковных метриках записывали строго по святцам — с «и», а не с народным «ы».