Фамилия Сисипукин — один из тех редких случаев, когда основа настолько необычна, что сразу заставляет задуматься: откуда такое взялось? В отличие от большинства русских фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров) или профессий (Кузнецов), здесь мы имеем дело с прозвищем, которое, скорее всего, возникло из диалектного или искажённого слова.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность — «чей?» — Сисипукин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Сисипука. Само прозвище, вероятно, восходит к глаголу «сисюкать» или «сисюнить» — в русских говорах так называли человека, который говорит шепеляво, с присвистом или сюсюкает. В некоторых диалектах «сися» означало «соска», «грудь», но в данном контексте прозвище вряд ли связано с кормлением — скорее, с манерой речи. Форма «Сисипука» могла быть экспрессивным, шутливым или уничижительным прозвищем для картавого или невнятно говорящего человека.

Версия о тюркском или финно-угорском корне маловероятна: фамилия не имеет характерных для таких языков суффиксов или корней. Скорее всего, это чисто русское диалектное образование, которое могло закрепиться в каком-то одном регионе — например, в северных или вологодских говорах, где встречаются похожие звукоподражательные прозвища. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна или В. Никонова) Сисипукин не фигурирует, что подтверждает её редкость и узколокальный характер.

Социальный контекст: носители фамилии почти наверняка были крестьянами или посадскими людьми, так как прозвища, а затем и фамилии на -ин в этой среде были нормой. Дворянские роды с такой основой не встречаются. Таким образом, предок носителя фамилии Сисипукин — человек, которого в деревне дразнили за его манеру говорить, и это прозвище закрепилось за его потомками.