Фамилия Сисюрко — яркий пример украинской модели фамилий на -ко, которая в XIX веке широко распространилась и на южнорусских территориях. Суффикс -ко в украинской ономастике — один из самых продуктивных. Он мог выполнять уменьшительную функцию, указывать на молодость носителя (сына), а в ряде случаев просто закреплялся как фамильный формант, не меняя смысла основы. В случае с Сисюрко основа, скорее всего, восходит к личному имени Сисой.

Имя Сисой — это русская и украинская народная форма канонического имени Сисой (от древнегреческого «Сисой», предположительно египетского происхождения). В святцах оно связано с несколькими раннехристианскими подвижниками. В народной среде имя было нередким, особенно среди крестьян и духовенства. От него образовались фамилии Сисоев, Сисой, Сисюк, Сисюра. Сисюрко — это вариант с дополнительным суффиксом -ур- (-юр-), который в украинской антропонимии часто придавал основе оттенок пренебрежительности или, наоборот, фамильярности, как в фамилиях Хомурко, Петрурко. То есть Сисюрко можно понять как «Сисойка» или «маленький Сисой», но в контексте фамилии это просто указание на родство с человеком по имени Сисой.

Версия о связи с прозвищем от украинского «сисуля» (плакса, нытик) менее вероятна, хотя и не исключена полностью. Такие прозвища обычно давали за характер, и они могли закрепиться в фамилии. Однако в украинской традиции фамилии на -ко чаще образуются от личных имён, а не от экспрессивных прозвищ с тем же суффиксом. Поэтому версия с именем Сисой выглядит предпочтительнее: модель «имя + -ур- + -ко» типична для западно- и центральноукраинских говоров.

Социально фамилия Сисюрко, как и большинство фамилий на -ко, исторически принадлежала непривилегированным сословиям — казакам, крестьянам, мещанам. Дворянские фамилии такой модели встречаются редко и, как правило, имеют польское или белорусское происхождение. Географически фамилия тяготеет к центральной Украине — Черкасской, Киевской, Полтавской областям, откуда в XIX–XX веках носители могли мигрировать на Кубань и в южные регионы России. Встречается она нечасто, что подчёркивает её локальный характер и относительно позднее закрепление в письменных источниках.