Фамилия Сивонина образована от прозвища или имени Сивоня, а тот корень — прилагательное «сивый», то есть седой, пепельный, серый. В старину «сивым» называли не только человека с ранней сединой, но и вообще бледного, белесого или даже голубоглазого — оттенок имелся в виду любой неяркий, выцветший. Так что прозвище Сивоня мог получить либо пожилой человек с заметной проседью, либо, наоборот, совсем светлый от природы ребёнок или взрослый с обесцвеченными волосами.

Суффикс -он- в основе указывает на уменьшительную или пренебрежительную форму: Сивоня — это «сивый» в бытовом, неофициальном варианте, как «серый» превращается в «серёня» или «серун». А окончание -ин в фамилии — типичный русский патроним: Сивонин буквально значит «сын Сивони». Такая модель (прозвище на -оня плюс -ин) встречается реже, чем обычные -ов/-ев, поэтому фамилия заметно выделяется на фоне массовых Сидоровых и Ивановых.

Географически Сивонины чаще всего встречаются в центральных и северных областях России — в Костромской, Вологодской, Кировской областях. Там диалектное слово «сивый» было в ходу, и прозвища от него давали легко. Встречаются и родственные фамилии: Сивов, Сиваков, Сивушкин, но Сивонина стоит особняком из-за редкого суффиксального оформления.

Двойников по звучанию у фамилии почти нет, хотя иногда путают с Сиваниной — но та происходит от имени Сиван (календарное Симеон в просторечии). Так что если вы Сивонина, ваши предки почти наверняка получили прозвище по внешности: седоватый, светлый, «сивый» человек, и фамилия закрепилась именно в такой ласкательной или прозвищной форме.