Фамилия Скипочка — редкий пример того, как прозвище, связанное с музыкальным инструментом, закрепилось в украинской и южнорусской антропонимии. Её основа — слово «скипка», которое в украинских говорах означает скрипку. Уменьшительный суффикс -очк- указывает на то, что прозвище Скипочка могло относиться к человеку небольшого роста или молодому музыканту-скрипачу, либо было дано в ласкательной форме. Такой суффикс — нечастое явление в фамилиях, что делает Скипочку морфологически примечательной: это не отчество (как большинство русских фамилий на -ов/-ев), а усечённое прозвище, сразу застывшее в уменьшительной форме.

Вероятнее всего, фамилия возникла на территории современной Украины или в южных областях России, где были распространены украинские говоры. Прозвище Скипочка мог получить скрипач, который играл на свадьбах и ярмарках, или же мастер, делавший скрипки. В славянской традиции музыканты нередко получали прозвища по инструменту: Гуслик, Бубен, Сопилка. Скипочка органично вписывается в этот ряд. Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным глаголом «скипати» (отделять, отщеплять), тогда прозвище могло относиться к ремесленнику, работающему с деревом или лучиной, но это предположение слабее, поскольку прямой параллели с фамилией в ономастических источниках не прослеживается.

Фамилия не попала в число распространённых дворянских или купеческих родов: её носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами, и фамилия закрепилась в устной традиции. Встречается она в основном в украинских областях, а также в диаспоре. Сравнение с однокоренными фамилиями — Скрипка, Скрипаль, Скипка — показывает, что Скипочка сохранила более архаичную и диалектную форму, которая в центральных русских говорах не прижилась.