Фамилия Скиртаченко — яркий пример украинской модели образования фамилий на -енко. Эта модель, широко распространённая в Левобережной и Степной Украине, изначально указывала на принадлежность: Скиртаченко — буквально «сын Скиртача» или «тот, кто из рода Скиртачей». Суффикс -енко в XVII–XVIII веках закрепился как основной способ формирования фамилий у казаков и крестьян, особенно в Черниговской, Полтавской и Харьковской губерниях.

Основа фамилии — прозвище Скиртач. В основе лежит слово «скирта» — большой стог сена или соломы, уложенный особым способом для хранения под открытым небом. Скиртачом называли человека, который умел правильно и плотно укладывать скирды, чтобы сено не гнило и не промокало. Это было важное и уважаемое ремесло в земледельческих хозяйствах, ведь от качества скирдования зависела сохранность корма на зиму. Прозвище могло закрепиться и за хозяином, владевшим большими скирдами, или за работником, чья специализация была именно в этом.

Встречаются и другие версии, но они менее убедительны. Например, связь с тюркским словом «скирт» (спина) или с греческим «скиртос» (прыгающий) — эти гипотезы не имеют под собой ни географической, ни исторической опоры для украинского ареала. В словаре украинских фамилий Ю. Редько прямо указывает на происхождение от «скирта», что подтверждается и обилием однокоренных фамилий: Скирта, Скиртюк, Скиртач.

Фамилия Скиртаченко остаётся относительно редкой. Её носители встречаются преимущественно в центральных и восточных областях Украины, а также в России, куда фамилия попала в ходе миграций конца XIX — начала XX века. В дореволюционных переписях её обладатели чаще всего числились крестьянами или казаками — людьми, чья жизнь была тесно связана с землёй и скотоводством.