Фамилия Скобюк — яркий пример украинской модели фамилий на -юк, распространённой на западе и в центре Украины. Суффикс -юк (как и -чук, -ак, -ук) в украинской ономастике указывал на сына или потомка человека, названного в основе. То есть Скобюк — это «сын Скоба» или «потомок Скоба». Такая модель была особенно популярна в Подолье, на Волыни и в Галичине, где фамилии на -юк и -чук носили крестьяне и казаки, часто без сословного оттенка.

Основа фамилии — прозвище Скоб. В русских и украинских говорах «скоба» — это металлическая дужка, скрепка, а также инструмент для скрепления досок или бревен. Прозвище Скоб могли дать либо плотнику, либо кузнецу, либо человеку, который постоянно что-то скреплял или подгонял — по ассоциации с характером или занятием. Встречается и другая версия: в некоторых диалектах «скоб» означало «скупой», «прижимистый» — тогда прозвище носило бытовой, оценочный характер.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что Скобюк стоит в одном ряду с более распространёнными Скобов, Скобин (русская модель на -ов/-ин) и Скобель (польско-украинская основа от «скобель» — инструмент для строгания). Но именно форма на -юк выдает украинское происхождение и чаще всего встречается в исторических записях Волынской и Ровенской областей. Фамилия не является аристократической: её носители в XIX веке числились преимущественно среди крестьян и мещан.

В написании возможны варианты: Скобюк (стандартное украинское) и реже Скобюк с ударением на последний слог — это зависит от местной традиции. В русскоязычной среде фамилию могли записывать как Скобюк, так и Скобюк без изменения окончания, так как суффикс -юк в русском языке не склоняется по падежам как типичное украинское окончание.