Фамилия Скрынникова относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на род занятий человека. В данном случае в основе прозвище Скрынник лежит старинное слово «скрыня», то есть «сундук, ларец». Скорее всего, Скрынником прозвали либо мастера по изготовлению таких коробов, либо продавца скрынь. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Скрынник, со временем получил фамилию Скрынникова.