Фамилия Скрыпицын — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано не с характером человека, а с его профессией или инструментом. Вопреки интуитивному желанию связать её со словом «скрипеть» или «скрипка», корень здесь иной. Скорее всего, в основе лежит диалектное «скрыпица» — так в некоторых русских говорах называли особый вид заступа, лопаты или скребка, а также деталь ткацкого станка. Человек, получивший прозвище Скрыпица, мог быть землекопом, плотником или ткачом — мастером, работавшим с этим специфическим орудием.

Модель образования фамилии стандартна для центральной России: суффикс -ын указывает на принадлежность. Скрыпицын буквально означает «сын Скрыпицы» или «из семьи Скрыпицы». Суффикс -ын характерен для фамилий, образованных от основ на -а, -я, что подтверждает женский или уменьшительный характер исходного прозвища. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще давались по именам отцов, фамилии на -ин нередко закреплялись за потомками людей, известных по прозвищу или роду занятий.

В ономастике существует и другая, менее вероятная версия: связь с глаголом «скрыпеть» (скрипеть) в значении «говорить скрипучим голосом» или «быть ворчливым». Однако такая мотивация встречается реже, так как для прозвищ по голосу чаще использовали формы вроде Скрипун или Скрипач. Географически фамилия Скрыпицын встречается в основном в Поволжье и центральных областях России, что косвенно указывает на диалектную природу корня.

Примечательно, что написание через «ы» после «р» — архаичное. В древнерусском языке после твёрдых согласных перед гласными нередко писали «ы» там, где позже закрепилось «и» (ср. «крыло» и «крило»). Таким образом, фамилия сохранила старое произношение, которое в литературном языке утратилось. Если бы фамилия возникла позже или в регионе с акающим говором, она, вероятно, писалась бы как Скрипицын. Эта орфографическая особенность — дополнительная подсказка: предки Скрыпицыных, скорее всего, жили в местности, где сохранялось оканье и древнее произношение твёрдого «р».