Фамилия Скрыпко — яркий пример украинской модели фамилий на -ко, которая в XVI–XVII веках была одной из самых продуктивных в словообразовании. Суффикс -ко в украинской антропонимии выполнял несколько функций: он мог указывать на молодого человека, сына, либо придавать прозвищу уменьшительно-ласкательный или фамильярный оттенок. В основе фамилии лежит прозвище Скрып, образованное от глагола «скрыпіти» — скрипеть. Скорее всего, так называли человека по характерному звуку: либо того, кто постоянно скрипел (например, дверью, телегой, сапогами), либо обладателя скрипучего голоса.

Вероятно, прозвище могло относиться и к ремеслу: скрыпалем на Украине называли музыканта, играющего на скрипке (сам инструмент в народе называли «скрипка» или «скрыпа»). Таким образом, Скрыпко — это потомок человека, который либо играл на скрипке, либо был известен своим скрипучим поведением или походкой. Вторая версия менее вероятна, так как для музыканта чаще использовали суффиксы -ар/-яр (Скрыпарь, Скрипаль), но полностью исключать её нельзя — в народной среде прозвища часто возникали спонтанно.

В украинских реестрах и переписных книгах XVII–XVIII веков фамилия встречается преимущественно на Левобережной Украине, особенно в Черниговской и Полтавской губерниях. Там же фиксируются и однокоренные варианты: Скрыпка, Скрыпник, Скрыпченко. Интересно, что в русском языке фамилия сохранила украинское написание через «ы» (Скрыпко), а не через «и» (Скрипко), что указывает на фонетические особенности юго-западных говоров. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые преобладали у великорусского дворянства и крестьянства, Скрыпко осталась в среде казачества и мещан — это фамилия простого сословия, без дворянских притязаний.

С точки зрения словообразования, фамилия Скрыпко — типичный представитель украинской патронимической (или прозвищной) модели, где основа — краткое имя или прозвище, а суффикс указывает на принадлежность. Аналогов в других славянских языках почти нет: белорусская форма была бы Скрыпка, польская — Skrzypko, но с другим корнем. Сегодня фамилия встречается не только в Украине, но и в южных областях России, куда переселялись казаки, и в диаспоре.