Фамилия Скулкина образована от прозвища Скулка, и здесь есть две основные версии, которые ведут к разным смыслам. Первая отсылает к украинскому нарицательному «скулка» — нарыв, болячка. Но напрямую связывать прозвище с человеком, чьё лицо покрыто прыщами, было бы слишком прямолинейно. В народной традиции такие имена-обереги давали наоборот: родители, надеясь уберечь сына от болезней и вырастить его красивым и здоровым, могли назвать его Скулкой, как бы «отводя» беду.

Вторая версия выглядит более прозаичной и связана с русским словом «скулы» — кость черепа, выступающая под глазами над верхней челюстью. В этом случае Скулкой прозывали человека с крупными, выдающимися скулами. Такая внешняя особенность — самая частая причина для возникновения прозвищ, поэтому эта гипотеза кажется более правдоподобной, хотя и не отменяет первую.

Обе версии сходятся в одном: в основе лежит не крестильное имя, а прозвище, которое давали в быту, чтобы отличить человека по характерной черте. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Скулкина — это «дочь Скулки» или «жена Скулки», то есть потомок человека с таким прозвищем. Форма с конечным -а закрепилась за женской линией или за именем замужней женщины, тогда как мужской вариант — Скулкин.

Прозвища, образованные от названий болезней или частей тела, встречаются в русских фамилиях нередко, но Скулкина стоит немного особняком: она не такая распространённая, как, скажем, Ушаков или Носов, и сохраняет связь с диалектным, возможно, южнорусским или украинским словом. Точно сказать, где именно впервые появилась фамилия, сейчас сложно — переписи и ревизские сказки фиксировали её в разных губерниях, но единого родового гнезда не видно. Как бы то ни было, предок носительницы этой фамилии был человеком с приметной внешностью или же носил имя-оберег, данное с надеждой на добрую судьбу.