Фамилия Скулыбердина — женская форма от Скулыбердин, и её разговорный, почти игровой характер сразу бросается в глаза. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от крестильных имён или профессий, эта явно выросла из прозвища. Основа «скулыберда» или «скулыбердить» в русских говорах означала «вертеться, суетиться без толку, делать что-то несерьёзное», а также могла относиться к человеку, который «скулит» или капризничает. Корень здесь — «скул-» (от «скулить» — жаловаться, ныть) с экспрессивным суффиксом «-ыберд-», который придаёт слову оттенок насмешки и пренебрежения. Такая модель характерна для диалектной лексики: «ерыжить», «кувыркать» — здесь та же игровая приставка и суффикс.

По способу образования фамилия типична для северных и северо-восточных регионов России, где были распространены прозвищные фамилии на -ин. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Скулыбердин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Скулыберда. В документах XVII–XVIII веков подобные прозвища фиксировались в вятских и пермских землях, где охота и промыслы порождали меткие бытовые клички. Скулыбердой могли назвать суетливого, беспокойного мужика, который вечно жалуется на жизнь, или, наоборот, балагура, который «скулыбердит» — то есть болтает без умолку.

Вторая версия, менее вероятная, связывает фамилию с искажённым тюркским словом, но она не находит серьёзной поддержки у ономастов: звуковой облик «скулыберда» слишком органичен для русской диалектной лексики, а не для заимствований. В современном бытовании фамилия редкая, встречается в основном на Урале и в Кировской области, что подтверждает её локальное происхождение.

Таким образом, предки носительницы фамилии Скулыбердина, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими прозвище за характер — ворчливый, суетливый или чрезмерно разговорчивый. Фамилия несёт в себе живую народную речь, которая в XVIII–XIX веках закрепилась в официальных документах.