Фамилия Скупнова — женская форма от Скупнов, а та образована от прозвища или нецерковного имени Скупной. В основе лежит прилагательное «скупной» — в старых говорах так говорили о человеке прижимистом, расчётливом, не склонном к тратам. Прямого отношения к скупости как пороку могло и не быть: в крестьянской среде бережливость часто считалась добродетелью, а прозвище Скупной мог получить хозяин, умеющий вести хозяйство без лишних расходов.

Суффикс -ов типичен для русских фамилий, образованных от прилагательных с окончанием -ой: Скупной → Скупнов. Такая модель встречается реже, чем фамилии на -ин от слов на -а/-я, что делает Скупновых немногочисленной, но устойчивой группой. В документах XVII–XVIII веков прозвище Скупной фиксируется в разных уездах, особенно на севере и в центральной России, где ценилась хозяйственная сметка.

Есть и другая, менее вероятная версия: от диалектного «скуп» — обрыв, крутой берег. Тогда Скупной — человек, живший у такого обрыва. Но эта гипотеза слабее, потому что топонимические прозвища обычно давали по названию местности (Скупов, Скупин), а не через прилагательное. К тому же фамилия Скупнова встречается преимущественно в областях, где «скупной» в значении «бережливый» было обычным словом.

Географически фамилия рассеяна, но заметна в Поволжье и на юге России. Встречается в Нижегородской, Самарской, Ростовской областях — там, где оседали бывшие государственные крестьяне. Сословно предки Скупновых скорее всего были крестьянами или мещанами, но точных данных о дворянских ветвях нет. Фамилия не относится к числу распространённых, поэтому каждый её носитель может с высокой вероятностью проследить род до одного-двух корней.