Фамилия Слабышева — женская форма фамилии Слабышев. В её основе лежит прозвище или нецерковное имя Слабый, Слабыш. В древнерусской антропонимии такие имена давали не столько для описания физической немощи (хотя и это не исключено), сколько как имя-оберег: считалось, что «слабого» ребёнка не тронут злые силы, он вырастет крепким и здоровым. Параллель — распространённые имена Некрас, Нелюб, Немил.

Словообразовательная модель проста: к основе «слаб-» добавили суффикс «-ыш-» (как в словах «малыш», «глупыш»), а затем патронимический суффикс «-ев». Суффикс «-ев», а не «-ов», указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или шипящий: Слабыш → Слабышев. Это типичный разряд «отпрозвищных» фамилий, характерный для северных и центральных областей России.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с прилагательным «слабый» в значении «небогатый, скудный». В некоторых говорах «слабый» могло относиться к хилому урожаю или тощему скоту. Тогда Слабышем прозвали человека, жившего на скудной земле или державшего плохую скотину. Однако эта гипотеза уступает первой по распространённости: в ономастике имена-обереги встречаются гораздо чаще, чем прозвища по хозяйственному признаку.

Фамилия редкая, в списках столбовых дворянских родов не значится. Скорее всего, Слабышевы — потомки крестьян или посадских людей. Встречается фамилия в основном в Поволжье и на юге России, что может указывать на миграцию носителей из центральных губерний в XVII–XIX веках. Однокоренные фамилии — Слабин, Слабков, Слабожанин — имеют ту же смысловую основу, но образованы по другим моделям.