Фамилия Слипухин — редкий пример отчества, образованного не от имени, а от прозвища, связанного с физической особенностью. Основа здесь — прилагательное «слипухой» (или «слипухий»), то есть «слепой, подслеповатый, плохо видящий». В русских говорах слово «слипуха» означало не только слепого человека, но и крота, а также могло применяться к тому, кто щурится или плохо различает предметы в сумерках. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Слипухин — «сын Слипухи» (человека по прозвищу Слипуха).

Интересно, что фамилия избежала типичной для таких основ суффиксальной схемы -ов/-ев. Если бы прозвище звучало как Слипух, мы бы получили Слипухов. Но форма Слипуха — более старая, с окончанием -а, характерным для прозвищ в северных и центральных говорах. Именно от неё пошли фамилии на -ин: Слипухин, а также параллельные Слипушин, Слепухин (от «слепуха»). В ономастическом словаре Б. Унбегауна такие модели описаны как типичные для прозвищ, обозначающих внешность или здоровье.

Географически фамилия привязана к Поволжью и югу России. В архивных записях XIX века Слипухины встречаются в Саратовской, Самарской и Астраханской губерниях, а также среди казачества. Это объяснимо: прозвища, данные по зрению, были распространены в среде, где требовалась острота глаза — у охотников, рыбаков, пастухов. Прозвище могло закрепиться за человеком, который, несмотря на слабое зрение, выполнял свою работу, или же, наоборот, получил его в насмешку.

Версия о связи фамилии со словом «слипать» или «слипнуться» (в значении «склеиваться») маловероятна: для такого корня ожидалась бы форма Слипкин или Слипков. Прозвище Слипуха однозначно восходит к зрительному недостатку, и это подтверждается живыми диалектными данными, собранными, в частности, в «Словаре русских народных говоров». Таким образом, Слипухин — фамилия, прямо говорящая о предке: он был не просто «слеповатым», а носил характерное прозвище, которое его дети приняли как родовое имя.