Фамилия Слупенко — характерный пример украинской модели образования фамилий на -енко. Этот суффикс, самый массовый на востоке и юго-востоке Украины, изначально означал «маленький» или «сын»: Слупенко — буквально «сын Слупы» или «малый Слупа». В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые застывали в форме притяжательного прилагательного, украинские фамилии на -енко сохраняли значение родства и уменьшительности, что указывает на их формирование в среде казачества и крестьянства в XVI–XVII веках.

Основа фамилии — прозвище Слупа. Его происхождение неочевидно, но есть две основных версии. Первая связывает его с диалектным глаголом «слупить» — ободрать кору, снять кожуру, а в переносном смысле — обобрать, обмануть. В таком случае Слупой могли прозвать человека, занимавшегося лущением зерна или сдиранием лыка, либо же, в негативном ключе, пройдоху и обдиралу. Вторая версия выводит прозвище из польского «słup» — столб. В польском влиянии на украинские земли нет ничего необычного, и Слупой могли назвать высокого, худого и прямого, как жердь, человека.

Географически фамилия Слупенко распространена прежде всего в центральных и восточных областях Украины — в Черкасской, Полтавской, Сумской областях. Встречается она и в России, но почти исключительно в регионах, граничащих с Украиной, или в местах массового переселения украинцев в XVIII–XIX веках (Кубань, Дон, Слобожанщина). Среди однокоренных фамилий — Слупский, Слупов, Слупинский, причём последние две, скорее всего, имеют уже русскую или польскую огласовку.

Таким образом, Слупенко — фамилия недворянская, крестьянско-казацкая. Её носитель с большой вероятностью был выходцем из украинских земель, а его предок получил прозвище либо по занятию, связанному с обработкой дерева или лущением, либо по внешней особенности — за высокий рост и худобу. В любом случае, без дополнительных архивных изысканий определить, какая из версий верна для конкретной семьи, невозможно.