Фамилия Содомитов звучит одиозно, но её происхождение куда прозаичнее, чем может показаться. В основе лежит не библейский город Содом в прямом значении «грех», а старое русское прозвище Содом — так в народе называли шумного, крикливого человека, зачинщика ссор и беспорядка. Слово «содом» в говорах означало «шум, гам, суматоха, скандал» (ср. «содом и Гоморра» в переносном смысле — «неразбериха»). Прозвище давали не за моральный облик, а за неуживчивый характер или привычку создавать переполох.

Фамилия образована по стандартной патронимической модели: основа Содом + суффикс -ит (вариант -итов, указывающий на принадлежность к роду) + окончание -ов. Суффикс -ит здесь редкий, но встречающийся в русских фамилиях, особенно в среде духовенства и купечества (ср. фамилии типа Агентов, Дьячковит). В сочетании с -ов получается «Содомитов» — буквально «сын Содома» или «из рода Содома». Такая форма характерна для фамилий, возникших в XVII–XIX веках, когда прозвища уже закреплялись как наследственные.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным губерниям России — Вологодской, Костромской, Вятской, где слово «содом» в значении «шум, ссора» было особенно употребительно. В переписных книгах XVIII века встречаются крестьяне и посадские люди с прозвищем Содом. Священническая среда тоже давала такие фамилии, но реже: в семинариях «благозвучные» фамилии часто переделывали, а Содомитов оставляли как необычную, но не ругательную — из-за бытового, а не религиозного корня.

Современное звучание фамилии вводит в заблуждение: носители могут стесняться своей фамилии из-за ложных ассоциаций. Но этимологически Содомитов — такой же «шумный», как Крикунов или Галдин. Никакого отношения к пороку или библейскому сюжету прозвище не имело.