Фамилия Согомоняня — редкий случай, когда армянская по происхождению фамилия получила русское патронимическое окончание. Основа фамилии восходит к армянскому имени Согомон, которое является местной формой библейского имени Соломон (др.-евр. Шломо — «мирный»). Такое имя было широко распространено среди армян-христиан, особенно в среде духовенства и знати, поскольку Соломон почитается как царь-мудрец и строитель Иерусалимского храма.

Необычность формы «Согомоняня» — в суффиксе «-ян» (армянский патронимический показатель, означающий «сын» или «потомок») и дополнительном окончании «-я». В классическом армянском языке фамилия выглядела бы как Согомонян (Согомонов). Но здесь мы видим, что к армянской основе добавили русский суффикс притяжательности — фактически, фамилию «дважды» оформили как отчество: сначала по-армянски (Согомонян), потом по-русски (Согомонянов). Окончание «-я» вместо «-ов» указывает на то, что фамилия закрепилась в форме, характерной для южнорусских говоров или украинского влияния, где «-я» могло заменить «-ов» при ассимиляции.

Такая двойная модель образования — армянская основа + русский суффикс — встречается у фамилий, которые возникли на границе культур, например, на Кубани, в Ставрополье или в Крыму, где армянские переселенцы в XIX веке активно встраивались в русскую сословную систему. Носители фамилии Согомоняня, скорее всего, были потомками армянских ремесленников, купцов или священников, которые при переписи населения получили фамилию с русским окончанием для упрощения документооборота. При этом исходное имя Согомон могло принадлежать не отцу, а деду или более раннему предку, чей род выделили отдельной ветвью.

Географически фамилия почти не встречается в исторической Армении — она локализуется в основном на юге России и в восточной Украине, где армянские общины были многочисленны. В современном виде она крайне редка: по открытым данным, в России живут единичные носители, в основном в Краснодарском крае и Ростовской области. Это объясняется тем, что в советское время многие армянские фамилии «русифицировали» до более привычных форм (Согомонов, Согомонян), и вариант с двойным окончанием сохранился лишь у тех семей, которые не меняли написание.