Фамилия Столушенко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которая указывает на происхождение от отца или его занятия. Суффикс -енко в украинской ономастике означает «сын» или «потомок», а в более широком смысле — «принадлежащий к роду того, кто назван в корне». Поэтому Столушенко — это буквально «сын Столуши».

Основа фамилии — прозвище Столуша. Слово «столуша» в украинских и южнорусских говорах имеет два возможных значения. Первое — уменьшительная или пренебрежительная форма от «стол», то есть человек, связанный со столом: либо столяр, изготавливающий столы, либо тот, кто за столом сидел — приказной или писарь. Второе значение — диалектное «столуша» как «столб» или «подпорка», что могло быть прозвищем высокого, худого или прямолинейного человека. Оба варианта правдоподобны, но первое — с ремесленной или социальной привязкой — встречается чаще.

Географически фамилия Столушенко тяготеет к центральной и восточной Украине, где типичны фамилии на -енко. В исторических документах XIX века её носители могли быть крестьянами или казаками, но точных сословных данных нет. В России фамилия встречается редко, обычно как результат миграции украинцев.

Уникальность фамилии в том, что она образована не от полного имени или распространённого ремесла (как Столяренко), а от разговорной, почти бытовой формы «Столуша». Это говорит о том, что прозвище давали в узком кругу, возможно, в сельской общине, где человека знали по его работе или внешности. Сравните с однокоренными Столбов, Столыпин — у Столушенко более «домашний», уменьшительный оттенок, что редко встречается в фамилиях такого типа.