Фамилия Стонюсова — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа — «Стонюс» — не встречается в современных русских именах и прозвищах, что сразу наводит на мысль о нерусском корне. Скорее всего, перед нами пример фамилии, образованной от литовского или польского имени либо прозвища. В литовском языке есть имя «Stonys» (Стонис) — краткая форма от «Stanislovas» (Станислав). Суффикс «-ус» в форме «Стонюс» — типично литовский, он часто появлялся при адаптации имён в польской или белорусской среде. То есть исходное прозвище или имя «Стонюс» могло быть вариантом «Станислава» или самостоятельным именем, а фамилия Стонюсова — это женская форма от мужской Стонюсов.

Модель образования простая: к основе «Стонюс» добавили русский патронимический суффикс «-ов», а затем окончание «-а» по женскому роду. Такая фамилия могла появиться в семьях, живших на западе Российской империи — в Литве, Беларуси или на Смоленщине, где смешивались славянские и балтские традиции именования. В этих краях литовские корни в фамилиях не редкость, и Стонюсова — один из тех случаев, когда фамилия сохранила память о балтском предке.

Есть и альтернативная, но менее вероятная версия: связь с диалектным словом «стонюс» — так в некоторых говорах могли называть человека, который часто стонет, жалуется. Однако для русского прозвища форма на «-юс» нетипична. В русском языке такие окончания встречаются редко (например, «Ванюс» от Иван), но они скорее заимствованы из западных языков. Поэтому литовская версия выглядит убедительнее.

География фамилии сегодня неширокая. Стонюсова встречается в основном в центральных и южных областях России, но носителей немного. Это не массовая фамилия, а скорее локальная, сохранившаяся в нескольких родах. Если ваши предки носили эту фамилию, вероятно, они происходят из западных губерний или из семей, переселившихся оттуда в XIX–XX веках.