Фамилия Стонина — редкий случай, когда на первый взгляд понятное слово может ввести в заблуждение. В основе лежит не камень и не «стон», хотя такие версии возникают сразу. На самом деле, скорее всего, перед нами «материнская» фамилия, образованная от женского имени или прозвища.

Разбираем суффикс. Окончание -ин указывает на принадлежность: Стонин — значит «сын Стони». Мужская форма Стонин встречается редко, а женская Стонина закрепилась в документах. Но от какого имени образована основа? В древнерусских и польских источниках известно имя Станислав (от «стань» и «слава»). В бытовой, сокращённой форме оно звучало как Стан, Станя или Стоня. Отсюда — Стоня, а затем и Стонин. То есть предок мог быть сыном человека по имени Стоня (домашняя форма Станислава).

Есть и вторая, менее очевидная версия. В некоторых говорах слово «стонать» имело не только прямое значение «издавать стон», но и переносное — «жаловаться, ныть, быть недовольным». Прозвище Стоня могли дать человеку ворчливому или болезненному. Однако такая гипотеза слабее: прозвища от глаголов чаще образовывались с суффиксом -ун (Стонун), а не -ня.

Географически фамилия Стонина встречается в центральных и северных областях России, но нигде не образует плотных гнёзд. Это нетипичная для крестьянского сословия модель: обычно крестьяне носили фамилии на -ов/-ев, а -ин чаще встречался у людей, получивших фамилию от матери или от прозвища на -я. Возможно, носители происходят из среды однодворцев или мещан, где фамилии могли быть менее стандартизированы.

В итоге: Стонина — это «сын (или дочь) Стони», а Стоня, вероятнее всего, сокращение от Станислав. Фамилия редкая, и её носителям стоит искать корни в документах XVII–XVIII веков, где могла фигурировать запись «Стоня» как личное имя или прозвище.