Фамилия Стюбко звучит необычно для русского уха, и это первый ключ к её происхождению. Скорее всего, перед нами фамилия украинская или белорусская, образованная по характерной для этих языков модели. Суффикс -к-о (Стюбк-о) в восточнославянской ономастике — классический уменьшительный или «сыновний» формант. Он присоединялся к основе личного имени или прозвища и означал «маленький», «младший», а позже закрепился как фамильный. Таким образом, Стюбко — это потомок человека по прозвищу Стюба.

Корень фамилии — стюб- — самый интересный и спорный момент. В русском литературном языке такого слова нет. Наиболее правдоподобная версия отсылает к диалектному глаголу «стюбать» или «стёбать», который в южных и западных говорах (особенно в украинском и белорусском) означает «стегать», «хлестать», «бить прутом». Прозвище Стюба могли дать либо человеку с резким, «колючим» характером, либо, напротив, тому, кто часто работал с прутьями, хворостом — например, корзинщику или пастуху, подгоняющему скот. Есть и более редкая версия, связывающая корень со словом «стюбень» (студень, холодец) — в этом случае прозвище могло относиться к медлительному или мерзлявому человеку, но она менее убедительна, так как не объясняет глагольной природы основы.

Географически фамилия Стюбко тяготеет к западу исторической России. Её носители встречаются в Беларуси (особенно в Гродненской и Брестской областях) и в западных областях Украины (Волынь, Ровенщина). В России она редка и, вероятно, появилась в результате миграций конца XIX — начала XX века. Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Стюбко стоит в одном ряду с более распространёнными Стёпиным, Стёпкиным (от имени Степан), но уходит корнями не к имени, а к прозвищу, что делает её более редкой и самобытной.

Социальный состав носителей фамилии, скорее всего, был крестьянским или мещанским. Фамилии на -ко в украинской и белорусской среде долгое время оставались беспаспортными «уличными» прозваниями и закрепились официально только в XIX веке, после отмены крепостного права. Значит, предки Стюбко были простыми людьми, и их прозвище — живое, бытовое, связанное с повседневной жизнью или характером. Никаких дворянских корней или знаменитых однофамильцев в истории не зафиксировано, что только подтверждает народное, «низовое» происхождение фамилии.