Фамилия Судоргин образована от прозвища или мирского имени Судорга. В её основе лежит слово, которое в украинском языке имело два значения: «судорога», то есть непроизвольное сокращение мышц, и «горе, беда». Отсюда и две версии происхождения прозвища.

Согласно первой, Судоргой называли человека, страдавшего от частых припадков, или же того, кого преследовали несчастья, — бедняка, горемыку. Прозвище в таком случае носило описательный, бытовой характер. Однако более правдоподобной выглядит вторая версия, связанная с древней традицией «охранных» имён. Надеясь уберечь сына от злых сил и болезней, родители могли намеренно дать ему неблагозвучное, отталкивающее имя Судорга. Считалось, что такой обманный приём отведёт от ребёнка беду: мол, что взять с того, кого уже назвали несчастным? Парадоксальным образом это имя должно было обеспечить мальчику здоровье и удачу.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Судоргин буквально означает «сын Судорги», «ребёнок Судорги». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от личных имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Со временем прозвище закрепилось за главой семьи как основное именование, а затем перешло к потомкам уже в форме фамилии.

Сам корень «судорог-» встречается в русском языке повсеместно, но именно украинское звучание с усечением конечного согласного даёт форму «судорга». Это позволяет предположить, что фамилия могла возникнуть в южнорусских землях или в среде, испытавшей влияние украинской народной речи. Впрочем, фамилия Судоргин встречается в разных регионах, и окончательно говорить о точном месте её появления можно лишь после серьёзных генеалогических изысканий.

Фамилия Судоргин — самобытный памятник славянской культуры, сохранивший в себе отголосок народных верований и особенностей живой речи. Процесс формирования каждой отдельной фамилии был длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому общая картина происхождения рода Судоргиных складывается из множества частных семейных историй.