Фамилия Сукисян — одна из тех, что выдают армянское происхождение с первого взгляда. Её выдают суффикс -ян (в старой орфографии -янц), который в русской передаче закрепился как стандартный патронимический показатель. В Армении и в диаспоре фамилии на -ян означают «принадлежащий к роду такого-то» или «потомок такого-то». Соответственно, Сукисян — это «потомок Сукиса».

Основа фамилии — личное имя Сукис. Оно восходит к армянскому Սուքիաս (Suk‘ias), которое, в свою очередь, заимствовано из арамейского или сирийского. В основе лежит корень со значением «белый», «чистый», «блестящий» или «святой». В христианской армянской традиции имя Сукиас известно по святому Сукиасу — одному из первых армянских мучеников, пострадавших за веру. Поэтому фамилия Сукисян могла изначально указывать на потомка человека, названного в честь этого святого, или на человека, носившего имя с пожеланием чистоты и святости.

Модель образования проста: к имени Сукис добавляется патронимический суффикс -ян, который в диалектах мог звучать как -енц, -янц. В русской записи фамилия закрепилась без мягкого знака и с окончанием -ян, хотя в дореволюционных документах можно встретить вариант Сукисьянц. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, армянские фамилии не имеют сословной привязки: Сукисян мог быть и крестьянином, и ремесленником, и священником. Географически фамилия распространена по всей исторической Армении, но чаще встречается в областях, где было сильно влияние раннехристианских культов — например, в Тавушской и Гехаркуникской областях.

В русском языке фамилия склоняется как существительное мужского рода второго склонения: Сукисян, Сукисяна, Сукисяну. В женском варианте она не склоняется. Иногда путают с русской фамилией Сукин, но это разные корни: Сукин происходит от прозвища Сука (собака), а Сукисян — от имени.