Фамилия Супилина — женская форма, а её мужской вариант — Супилин. В основе, скорее всего, лежит прозвище или нецерковное имя Супила. Такие имена на -ила в древнерусской традиции были распространены: их давали по характерному действию или черте (Вялила, Крутила, Дубила). Глагол «супить» в русских говорах означал «хмурить, морщить, делать складки». Соответственно, Супилой могли назвать человека с насупленным, сердитым выражением лица, который постоянно ходил «супя брови». Это не столько указывает на злой нрав, сколько на внешнюю особенность — привычку хмуриться или нахмуренный лоб.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Супилин — это «сын Супилы» или «человек из семьи Супилы». Модель образования типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин широко бытовали у крестьян и посадских людей. В южных регионах аналогичную фамилию могли бы образовать с суффиксом -ов (Супилов), но в документах встречается именно вариант с -ин.

Интересная деталь: в некоторых говорах слово «супила» могло иметь иное значение — так называли не только хмурого человека, но и того, кто «супит» (собирает, морщит) что-то, например, ткань или кожу. В этом случае прозвище могло относиться к ремесленнику — скорняку или портному, который делал складки или сборки на изделиях. Однако первая версия — по мимике — выглядит более прямой и правдоподобной, поскольку прозвища по внешним признакам давали чаще, чем по узкой профессиональной операции.

Встречаемость фамилии невысокая, она редкая. Встречается в основном в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает её севернорусское происхождение — переселенцы из новгородских и вятских земель несли такие фамилии на восток. Сословно предки Супилиных, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, а не дворянами: фамилии на -ин от прозвищ с глагольной основой редко попадали в гербовники.

В современном языке фамилия звучит необычно, но этимологически прозрачна: стоит только вспомнить слово «насупленный», и происхождение становится очевидным.