Фамилия Супрун чаще всего объясняется прозвищем, которое давали ворчливому, угрюмому человеку. В старину слово «супрун» в народной речи действительно имело такое значение, и прозвище закреплялось за тем, кто отличался мрачным нравом или нелюдимым характером. Эта версия наиболее проста и правдоподобна: она напрямую связывает фамилию с особенностями поведения предка, по которым его опознали окружающие.

Существует и альтернативное объяснение, которое выводит основу из личного имени. В Белоруссии и на Украине бытовала форма Супрун как производный вариант канонического имени Софроний. Греческое имя Софроний переводится как «благоразумный», и в народной среде оно нередко упрощалось до более коротких и удобных в произношении форм. Однако эта версия выглядит менее убедительной: имя Софрон в русских говорах давало другие производные, а прозвище с отрицательной характеристикой характера встречается в ономастике гораздо чаще, чем переосмысление редкого имени.

Сама модель образования фамилии типична для восточнославянской традиции: прозвище или имя без дополнительного суффикса перешло в фамилию в своей исходной форме. Такое случалось, когда носитель был известен под этим прозванием настолько прочно, что не требовалось прибавлять к нему -ов или -ин. Подобные бессуффиксные фамилии характерны для украинской и белорусской среды, откуда фамилия Супрун и распространилась дальше.

Прозвище, легшее в основу фамилии, указывает на черты характера и особенности поведения. Ворчливый, угрюмый человек получал такое прозвание не как оскорбление, а как меткую бытовую характеристику, которая затем закреплялась за его потомками. В документах XIX–XX веков фамилия встречается в разных регионах, что говорит о ее широком бытовании среди крестьянства и казачества.

В Книге памяти Краснодарского края упоминается Супрун Александр Иванович (р. 1896) из станицы Ахтырской. В Книге памяти Оренбургской области записан колхозник колхоза «Красный комбайн» Супрун Алексей Иванович (р. 1880), проживавший в Переволоцком районе. Эти записи показывают, что фамилия была распространена и на Кубани, и в приуральских степях, куда ее принесли переселенцы с украинских и южнорусских земель.

Самым известным носителем фамилии стал Степан Павлович Супрун (1907–1941), дважды Герой Советского Союза, подполковник авиации. Около восьми лет он работал летчиком-испытателем, а с июля 1939 по январь 1940 года командовал группой истребителей в Китае, участвуя в боях с японскими захватчиками. В начале Великой Отечественной войны он командовал 401-м истребительным авиационным полком особого назначения на Западном фронте, сбил лично два и повредил один самолет противника. Погиб в бою с шестью вражескими истребителями, вторую звезду Героя получил посмертно. Его судьба показывает, что фамилия, некогда означавшая угрюмого ворчуна, не помешала потомку стать одним из самых отважных летчиков своего времени.