Фамилия Сускины, как и большинство русских фамилий, не имеет единственной бесспорной версии происхождения. Ономасты обычно предлагают две основные, и обе заслуживают внимания.

Первая версия — географическая. Она возводит прозвище Суска к названию деревни Суськи в Волынской области Украины. В этом случае фамилия указывает на выходца из этой местности. Такая модель была широко распространена: человека, переселившегося из деревни, называли по её имени, а за его потомками закреплялось прозвище, которое со временем становилось фамилией. Эта версия правдоподобна, но уязвима: деревень с похожими названиями в славянском мире несколько, и точно утверждать, что родоначальник Сускиных пришёл именно из волынских Суськов, нельзя.

Вторая версия — прозвищная, и она интереснее с точки зрения семантики. Она связывает основу фамилии со словом «суска» — уменьшительной формой устаревшего «суса». В некоторых говорах так называли не только меру сыпучих тел, но и нечто, связанное с торговлей, в частности — с продажей тканей. Отсюда возникает образ: прозвище Суска мог получить купец, торговавший восточными, заморскими материями, либо человек состоятельный, не жалевший денег на дорогие наряды. В этом случае фамилия отражает не место, а род занятий или характерную черту предка.

Словообразовательная модель проста: к основе «Суск-» добавили типичный русский суффикс притяжательности «-ин», который отвечает на вопрос «чей?». Такой суффикс чаще использовали для образования фамилий от основ на «-а» или «-я», что косвенно подтверждает: в основе лежало именно прозвище Суска, а не название деревни, от которого скорее ожидалась бы форма «Сусков» или «Суськов». Эта деталь делает прозвищную версию более убедительной.

Точное время возникновения фамилии Сускины определить невозможно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий и завершился в основной массе лишь к XIX веку. Неизвестны и точные места бытования, хотя можно предположить, что фамилия распространена в регионах, где пересекались украинские и русские земли. Фамилия Сускины — это памятник не только славянской письменности, но и бытовой культуры, в которой одинаково важны были и названия мест, и прозвища, данные по роду занятий.