Фамилия Свистухин образована от прозвища Свистуха. В русском языке суффикс -ух(а) часто придавал слову оттенок грубоватости или просторечия, а также указывал на человека, склонного к какому-то действию. Свистухой могли назвать того, кто постоянно насвистывает, любит свистеть — либо от веселого нрава, либо по привычке подавать сигналы свистом. В крестьянской и ремесленной среде свист не всегда поощрялся: в некоторых регионах его считали нечистым занятием, приманивающим нечистую силу, поэтому прозвище могло быть дано с неодобрительным оттенком — «пустой человек, бездельник».

Модель образования фамилии типична для восточнорусских и сибирских говоров. Суффикс -ин присоединялся к основам на -а/-я: Свистуха → Свистухин, то есть «сын Свистухи» или «принадлежащий Свистухе». Такая форма распространена в северных и центральных областях России, но географически фамилия Свистухин встречается относительно редко и чаще фиксируется в Поволжье и на Урале. В словаре Б. Унбегауна подобные фамилии на -ухин отмечены как характерные для недворянских слоев — крестьян и посадских.

Интересно, что прозвище Свистуха могло закрепиться и за женщиной — например, за бойкой, крикливой торговкой на базаре. В таком случае фамилия переходила по материнской линии, что в патриархальной России случалось реже, но не было исключением. Однокоренные фамилии — Свистунов, Свистков, Свистаков — образованы от других суффиксов и, как правило, несут то же значение, но без оттенка, который дает -ух(а).

Версия о происхождении от птицы свистухи (так в некоторых говорах называли утку-свиязь) маловероятна: прозвища от названий птиц обычно оформлялись суффиксами -ов/-ев (Свистунов, Свистков), а не -ухин. Так что основная и наиболее правдоподобная гипотеза — звуковое прозвище, данное человеку за манеру свистеть.