Фамилия Сынюта — яркий пример того, как украинская или белорусская модель словообразования превращает обычное прилагательное в фамилию с оттенком уменьшительности. В её основе лежит корень «син-», связанный с цветом: синий, сивый, сизый. Но, в отличие от более распространённых фамилий вроде Синявский или Синельников, суффикс «-юта» задаёт совсем другую стилистику.

Словообразовательный суффикс «-юта» в восточнославянских фамилиях встречается нечасто. Он характерен для украинских прозвищных фамилий, где придаёт оттенок ласкательности или, наоборот, ироничной уменьшительности. Сравните: Сынюта — буквально «маленький синий» или «синеватый». Такое прозвище могли дать человеку с заметной особенностью внешности: очень светлыми, почти сизыми глазами, синеватым оттенком кожи (например, из-за болезни или профессии, связанной с холодом), или же тому, кто постоянно носил одежду синего цвета.

Есть и вторая, менее очевидная версия. В некоторых говорах «синий» могло означать не только цвет, но и «холодный», «зябкий». Прозвище Сынюта могло закрепиться за человеком, который постоянно мёрз, кутался, или, напротив, за тем, кто работал на холоде — например, рыбаком или извозчиком зимой. В пользу этой гипотезы говорит то, что фамилия Сынюта имеет заметную географическую привязку: она встречается в основном на западе Украины (Волынь, Ровенская область) и в приграничных районах Беларуси, где зимы суровее, а диалектные черты речи сохранились лучше.

Фамилия не относится к дворянским или «географическим» (на -ский). Её носители — выходцы из крестьянской или казацкой среды, где прозвище давали по внешнему признаку или поведению. Встречается также вариант написания Синюта — с буквой «и» в корне. Это не ошибка, а следствие аканья или просто разнобоя в документах XIX века, когда писарь записывал фамилию на слух. Оба варианта считаются равноправными, хотя «Сынюта» с буквой «ы» более архаичен и точнее передаёт украинское произношение.