Фамилия Сюников — яркий пример того, как в русской фамилии может сохраниться редкая диалектная или иноязычная основа. Её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса: здесь он не стандартный -ов, а -иков. Это указывает на то, что фамилия образована не напрямую от прозвища Сюник, а от его производной формы Сюник, которая, в свою очередь, уже получила суффикс -ик. В русской ономастике такие модели (типа Сюник → Сюников) встречаются реже, чем простые отчества, и часто свидетельствуют о том, что основа была не церковным именем, а мирским прозвищем или названием профессии.

Корень «сюн-» почти наверняка не славянского происхождения. Самая правдоподобная версия — тюркская. В тюркских языках слово «сюн» или «сюнг» означает «кость» или «род» (ср. казахское «сүйек» — кость, род). Прозвище Сюник могли дать человеку крепкого телосложения, либо оно указывало на принадлежность к определённому роду или племени. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным глаголом «сюнить» (хныкать, ныть) — в таком случае прозвище носило бы характер насмешки над капризным или плаксивым человеком. Однако тюркская версия выглядит убедительнее, учитывая, что фамилии с корнем «сюн-» (Сюняев, Сюндуков) встречаются в Поволжье и на Урале, где исторически сильны тюркские влияния.

Фамилия Сюников — редкая. Её география, скорее всего, ограничена регионами, где русское население долго контактировало с тюркскими народами: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область. В центральной России она почти не встречается. Это позволяет предположить, что предки носителя фамилии были либо крестьянами, либо служилыми людьми на юго-восточных рубежах, воспринявшими тюркское прозвище в быту.

В справочниках по русским фамилиям Сюников не упоминается — это не «книжная» фамилия вроде Смирнова или Кузнецова, а живое, локальное образование. Её носитель, скорее всего, происходит из семьи, где прозвище Сюник закрепилось как родовое имя ещё в XVII–XVIII веках, а потом по законам русского языка получило типичный фамильный суффикс.