Фамилия Сюникова — женская форма фамилии Сюников. Её основа — мужское личное имя Сюник, а точнее — прозвище, которое в старину давали человеку с каким-то ярким признаком или по роду занятий. Разберём, что стоит за этим корнем.

Самая прямая версия: Сюник — это русская народная форма канонического имени Симеон (от древнееврейского «услышанный Богом»). В обиходе имя Симеон сокращали и переделывали: Сема, Сеня, а в некоторых говорах — Сюня. От Сюни с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса -ик (как Ваня — Ваник, Петя — Петик) и возникло прозвище Сюник. Тогда Сюниковы — потомки человека, которого в семье или в деревне звали Сюником, то есть уменьшительно-ласкательно от Симеона.

Есть и другая, менее распространённая, но возможная версия: Сюник могло быть прозвищем, связанным с диалектным словом «сюня» или «сюнька» — так в некоторых северных и сибирских говорах называли плаксу, нюню или, наоборот, тихоню. Прозвища по характеру — один из самых частых источников русских фамилий. Если так, то Сюников — это «сын плаксы» или «сын тихони», и со временем прозвище закрепилось как фамилия, потеряв первоначальный обидный смысл.

Фамилия образована по стандартной русской модели: основа + суффикс -ов. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей?» — Сюников, то есть «сын Сюника». Это типичная патронимическая фамилия, каких в России большинство. Географически фамилия не привязана к одной местности — встречается рассеянно, что характерно для фамилий, образованных от личных имён. Сословных ограничений у неё не было: Сюниковы могли быть и крестьянами, и мещанами, и духовенством (Симеон — частотное имя в среде священников).

Таким образом, Сюникова — это фамилия-патроним, скорее всего, от уменьшительной формы имени Симеон, реже — от прозвища по характеру. Точную версию для конкретной семьи может прояснить только история рода и местные говоры.