Фамилия Тимомеев, возможно, является вариантом фамилии Тимофеев, которая, в свою очередь, восходит к каноническому мужскому имени Тимофей. За проповедь христианской веры Тимофей был причислен к лику святых. Скорее всего, основатель рода Тимомеевых был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Тимофей, со временем получил фамилию Тимомеева.