Фамилия Тисеев — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В русском языке нет слова «тисей» или «тисея», поэтому сразу отбрасываем версию о прямом прозвище от нарицательного существительного. Ключ к разгадке — суффикс «-еев», который в русских фамилиях встречается реже, чем «-ов» или «-ин», и почти всегда указывает на иноязычную основу, чаще всего тюркскую или, реже, финно-угорскую.

Скорее всего, в основе фамилии лежит личное имя Тисе́й (или Тисей). Это имя могло быть вариантом канонического крестильного имени Тимофей, которое в народной речи часто сокращалось и видоизменялось: Тимоха, Тиша, Тися. Форма «Тисей» — одна из таких производных, где суффикс «-ей» выступает как уменьшительно-ласкательный (сравните: Алексей — Алёша, но и старые формы вроде Аксён от Авксентий). Соответственно, Тисеев — это «сын Тисея», то есть потомок человека, которого в быту звали Тисей.

Есть и вторая, менее вероятная, но возможная версия — тюркская. В некоторых тюркских языках (например, в татарском) встречается имя Тисей, которое может восходить к слову «тис» — «ровный, гладкий» или быть сложением с компонентом «-сей» (как в имени Исей). Если это так, то фамилия Тисеев могла возникнуть у крещёных татар или в среде служилых людей, где фамилии образовывали от тюркских прозвищ и имён по той же модели (Тисеев = из рода Тисея).

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и югу России. Встречается она в документах по Самарской, Саратовской и Оренбургской губерниям, что косвенно подтверждает вторую версию: именно в этих регионах было сильно смешанное русско-тюркское население, а фамилии на «-еев» (Андреев, Тимофеев) там нередко получали инородческое звучание при записи на русский лад. Первая версия (от Тимофея) проще и объясняет фамилию без привлечения экзотики, но вторая даёт более точный портрет предка — возможно, это был не просто крестьянин, а выходец из служилой татарской среды.