Фамилия Тишунова — женская форма фамилии Тишунов, и её происхождение напрямую связано с мужским личным именем или прозвищем. В основе лежит имя Тишун, которое является производной формой от канонического имени Тихон (от греческого «тихо» — «счастливый, удачливый») или от простонародной формы Тиша. Уменьшительно-ласкательный суффикс -ун- (как в именах Мишун, Гришун) указывает на то, что Тишуном называли младшего члена семьи, ребёнка или человека, к которому относились с теплотой. Таким образом, Тишун — это «маленький Тихон» или «Тиша», а Тишуновы — потомки этого человека.

Словообразовательная модель фамилии — патронимическая, с типичным русским суффиксом -ов. Она образована по схеме «чей?»: Тишун → сын Тишуна → Тишунов. Суффикс -ов указывает на принадлежность к роду и распространён в центральных и северных регионах России. Интересно, что фамилия могла возникнуть и от прозвища Тишун, которое давали спокойному, тихому человеку, — в этом случае она не связана с крестильным именем, а отражает личную черту характера предка.

Географически фамилия Тишунов (и её женская форма) встречается преимущественно в центральных областях России — в Вологодской, Костромской, Ярославской губерниях. В XIX веке Тишуновы нередко числились среди государственных крестьян и мещан. Встречаются и более редкие варианты написания — Тишунова с ударением на второй слог, что может указывать на северное происхождение (в некоторых говорах ударение смещалось на окончание).

Стоит отметить, что фамилия не имеет отношения к тюркским или иным заимствованиям — это чисто русское образование от православного имени. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные формы (Тишунов, Тишков, Тишин) рассматриваются как производные от Тихона. Споров о происхождении основы нет: как имя, так и прозвище хорошо документированы в переписных книгах XVII века.