Фамилия Тисунова — женская форма, а её мужской вариант, Тисунов, образован по самой распространённой в русском языке модели: от основы через суффикс -ов. Эта модель типична для фамилий, возникших из прозвищ или мирских имён, оканчивающихся на твёрдый согласный. Вопрос в том, что скрывается за основой «Тисун».

Самая вероятная версия связывает фамилию с диалектным словом «тисун». В северных и сибирских говорах так называли мастера, который занимался тиснением — нанесением узоров на кожу, бересту или металл. Тисуны были ремесленниками, украшавшими конскую упряжь, пояса, переплёты книг. Прозвище Тисун мог получить либо сам мастер, либо человек, который часто пользовался его услугами или жил рядом. В этом случае фамилия указывает на род занятий предка, что характерно для многих русских профессиональных прозвищ, перешедших в фамилии.

Менее распространённая гипотеза отталкивается от личного имени Тис. Имя Тис встречалось в старину, хотя и редко. Оно могло быть сокращением от крестильного имени Тимофей или Тигрий, а могло быть мирским, данным по названию дерева — тис. Такие «растительные» прозвища (Дуб, Сосна, Берёза) в народе давали по внешности или особенностям характера. Тогда Тисунов — сын Тиса, то есть отчество от редкого имени.

Обратим внимание на суффикс -ун в основе. В русском языке суффикс -ун часто образует названия лиц по действию: бегун, говорун, крикун. «Тисун» — тот, кто «тисает», то есть тиснит. Это делает версию о ремесленнике более весомой с точки зрения словообразования, чем гипотеза об имени Тис, где суффикс -ун выглядит наращением, нехарактерным для древнерусских уменьшительных форм.

Фамилия Тисунова встречается преимущественно в центральных и северных областях России, с заметным очагом в Вологодской и Архангельской губерниях, где тиснение по бересте и коже было развитым промыслом. Встречаемость фамилии невысокая, что говорит о её локальном происхождении и отсутствии массового распространения через дворянские или купеческие роды. Скорее всего, предки носителей фамилии были ремесленниками или крестьянами из северных деревень.