Фамилия Трисунова — женская форма фамилии Трисунов, а та, в свою очередь, образована от прозвища или нецерковного имени Трисун. Самая вероятная версия происхождения связана с глаголом «триснуть» — в южнорусских и украинских говорах это слово означало «трясти, качать, шатать», а также «бить, колотить». Прозвище Трисун мог получить человек с трясущейся походкой, либо, в переносном смысле, — тот, кто «трясёт» других, то есть задира или драчун. Есть и более прозаичное объяснение: «трисуном» называли того, кто постоянно трясёт что-то, например, выбивает пыль или веет зерно, — то есть прозвище могло закрепиться за работником по хозяйству.

Модель образования типична для русских фамилий: к основе на твёрдый согласный (-ун) добавляется суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Трисуна). Суффикс -ов — один из самых распространённых в России, он встречается у 60–70% всех фамилий. Фамилия Трисунова, таким образом, означает «дочь (или жена) Трисунова».

Интересно, что фамилия Трисун/Трисунова — редкая. В отличие от массовых фамилий вроде Иванов или Кузнецов, она не встречается в старых боярских списках или переписных книгах XVII века. Основной ареал её бытования — юг России (Ростовская, Волгоградская области, Краснодарский край) и восток Украины. Это косвенно подтверждает южнорусское происхождение глагольной основы. Встречаются также единичные носители в Сибири, что объясняется переселенческими потоками XIX–XX веков.

В написании фамилии возможна путаница: иногда её путают с Трисоновой (от имени Трисон, греческого происхождения) или с Тресуновой (от «треск»). Однако корень «трис-» с буквой «и» указывает именно на глагол «триснуть», а не на числительное «три» или что-то иное. Носительница фамилии Трисунова может с высокой долей вероятности считать своими предками крестьян или мещан южнорусских губерний, получивших фамилию по прозвищу, данному за особенность поведения или род занятий.