Фамилия Тхун — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не связано со славянскими корнями. В привычной для русских фамилий модели (суффиксы -ов, -ин, -ский) она стоит особняком: нулевое окончание, односложная основа, отсутствие типичных формантов. Это сразу указывает на то, что перед нами, скорее всего, фамилия иноязычная, пришедшая в русский язык через миграцию или культурное влияние.

Наиболее вероятная версия — немецкое происхождение. В немецком языке существует фамилия Thun (читается как «Тун»). Она может быть топонимической — от названия города Тун (Thun) в Швейцарии, на берегу одноимённого озера. По такой модели в немецкой традиции образовывались фамилии для выходцев из этого места: человек из Туна получал прозвище «der Thuner», которое со временем превратилось в фамилию Thun. Русское написание «Тхун» могло возникнуть при записи на слух: немецкое «Th» русские писцы или чиновники передавали как «Тх», чтобы подчеркнуть придыхательное произношение. Это объясняет необычное сочетание букв, которое для русского уха звучит как что-то среднее между «Тун» и «Тхун».

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование, — связь с вьетнамскими или китайскими фамилиями. Во вьетнамском языке существует фамилия Thân, но есть и созвучные варианты. Однако для фамилии Тхун, бытующей среди русскоязычных, немецкий след выглядит убедительнее: такие фамилии встречаются среди потомков немецких колонистов, переселявшихся в Российскую империю в XVIII–XIX веках (Поволжье, Причерноморье, Петербургская губерния). Там фамилии часто искажались при записи в метрические книги, и Thun мог превратиться в Тхун.

Если отбросить экзотические гипотезы, то ядро простое: основа фамилии — либо географическое название, либо личное прозвище. В немецком языке слово «Thun» как нарицательное не имеет ходового значения, поэтому топонимическая версия остаётся главной. Носитель фамилии Тхун в России — это, скорее всего, потомок выходца из немецкоязычных земель, чья фамилия была русифицирована на письме, но сохранила исходное звучание, отличное от славянских моделей.