Фамилия Тогонова — женская форма фамилии Тогонов, и её происхождение напрямую связано с мужским личным именем или прозвищем Тогон. Чтобы понять корни, стоит разобрать, откуда взялось это слово и какой суффикс его оформил.

Основа «Тогон» восходит к тюркским языкам. В большинстве случаев её возводят к тюркскому слову «тоган» — «сокол», «ястреб» или «хищная птица». В кочевой среде такое прозвище давали быстрому, зоркому или воинственному мужчине. Вторая версия, менее распространённая, связывает «Тогон» с тюркским же «тогон» — «родственник», «единокровный». Однако орнитологическое значение встречается в ономастике чаще и выглядит убедительнее: прозвища по птицам — один из древних пластов тюркской антропонимии.

Суффикс «-ов» в фамилии Тогонов указывает на типичную русскую модель образования от отчества или прозвища. То есть Тогонов — буквально «сын Тогона» или «принадлежащий Тогону». Фамилия оформилась в среде, где тюркские имена и прозвища попадали в русскую документальную традицию: при переписях и записях в метрические книги к основе добавляли русский патронимический суффикс. Это характерно для южных и восточных регионов России, особенно для Поволжья, Приуралья и Сибири, где издавна жили татары, башкиры, казахи и другие тюркские народы.

География фамилии Тогонова сегодня довольно узкая. Встречается она преимущественно у татар, башкир и казахов, а также у русских, чьи предки жили в смешанных тюрко-славянских поселениях. Много носителей в Оренбургской, Челябинской областях и в Башкортостане. Встречаются единичные случаи в Казахстане.

По сословной принадлежности предки Тогоновых чаще всего были государственными или ясачными крестьянами, реже — казаками. Дворянских родов с такой фамилией в исторических документах не зафиксировано. Фамилия не редкая, но и не массовая: её носители — потомки тех, кто в XVII–XIX веках носил прозвище Тогон, и за века оно превратилось в наследственное родовое имя.